Protein–RNA interactions for Protein: P27816

MAP4, Microtubule-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4P27816 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP4P27816 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4P27816 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4P27816 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4P27816 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4P27816 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4P27816 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP4P27816 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4P27816 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4P27816 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4P27816 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4P27816 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4P27816 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4P27816 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4P27816 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4P27816 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4P27816 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP4P27816 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4P27816 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4P27816 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4P27816 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4P27816 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4P27816 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4P27816 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4P27816 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4P27816 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MAP4P27816 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP4P27816 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP4P27816 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MAP4P27816 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MAP4P27816 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAP4P27816 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4P27816 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4P27816 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4P27816 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4P27816 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4P27816 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4P27816 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4P27816 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAP4P27816 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAP4P27816 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4P27816 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4P27816 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4P27816 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4P27816 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4P27816 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4P27816 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4P27816 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAP4P27816 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP4P27816 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAP4P27816 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms