Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX7P23759 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX7P23759 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX7P23759 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX7P23759 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX7P23759 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX7P23759 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX7P23759 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAX7P23759 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAX7P23759 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX7P23759 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX7P23759 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX7P23759 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX7P23759 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX7P23759 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX7P23759 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX7P23759 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX7P23759 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX7P23759 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX7P23759 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX7P23759 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX7P23759 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX7P23759 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX7P23759 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX7P23759 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAX7P23759 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAX7P23759 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX7P23759 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX7P23759 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX7P23759 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms