Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDSP20132 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SDSP20132 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SDSP20132 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SDSP20132 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SDSP20132 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SDSP20132 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDSP20132 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SDSP20132 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDSP20132 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDSP20132 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDSP20132 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDSP20132 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDSP20132 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDSP20132 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDSP20132 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDSP20132 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDSP20132 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDSP20132 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDSP20132 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDSP20132 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDSP20132 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDSP20132 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDSP20132 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDSP20132 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDSP20132 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDSP20132 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDSP20132 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDSP20132 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SDSP20132 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDSP20132 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDSP20132 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDSP20132 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDSP20132 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDSP20132 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDSP20132 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDSP20132 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDSP20132 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDSP20132 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDSP20132 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDSP20132 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDSP20132 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SDSP20132 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDSP20132 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDSP20132 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDSP20132 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDSP20132 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDSP20132 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDSP20132 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDSP20132 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDSP20132 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDSP20132 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDSP20132 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDSP20132 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SDSP20132 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDSP20132 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDSP20132 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDSP20132 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDSP20132 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDSP20132 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDSP20132 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDSP20132 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDSP20132 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDSP20132 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDSP20132 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDSP20132 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms