Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM21P19474 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms