Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT15P19012 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT15P19012 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT15P19012 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT15P19012 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT15P19012 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT15P19012 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT15P19012 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT15P19012 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT15P19012 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT15P19012 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT15P19012 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT15P19012 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT15P19012 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT15P19012 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT15P19012 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT15P19012 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT15P19012 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT15P19012 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT15P19012 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT15P19012 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT15P19012 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT15P19012 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT15P19012 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT15P19012 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT15P19012 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT15P19012 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT15P19012 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT15P19012 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT15P19012 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT15P19012 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT15P19012 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT15P19012 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT15P19012 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT15P19012 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT15P19012 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT15P19012 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT15P19012 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT15P19012 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT15P19012 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT15P19012 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT15P19012 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT15P19012 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT15P19012 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT15P19012 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT15P19012 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT15P19012 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT15P19012 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT15P19012 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms