Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC2P18074 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC2P18074 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC2P18074 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms