Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DESP17661 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DESP17661 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DESP17661 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DESP17661 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DESP17661 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DESP17661 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DESP17661 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DESP17661 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DESP17661 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DESP17661 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DESP17661 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DESP17661 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DESP17661 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DESP17661 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DESP17661 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DESP17661 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DESP17661 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DESP17661 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DESP17661 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DESP17661 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DESP17661 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DESP17661 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DESP17661 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DESP17661 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DESP17661 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DESP17661 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DESP17661 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DESP17661 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DESP17661 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DESP17661 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms