Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXB9P17482 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXB9P17482 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms