Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAV1P15498 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAV1P15498 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAV1P15498 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VAV1P15498 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAV1P15498 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAV1P15498 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAV1P15498 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAV1P15498 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAV1P15498 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAV1P15498 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAV1P15498 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAV1P15498 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAV1P15498 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAV1P15498 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAV1P15498 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAV1P15498 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VAV1P15498 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAV1P15498 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAV1P15498 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAV1P15498 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAV1P15498 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAV1P15498 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV1P15498 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV1P15498 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV1P15498 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV1P15498 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV1P15498 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAV1P15498 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV1P15498 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV1P15498 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV1P15498 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV1P15498 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV1P15498 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV1P15498 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV1P15498 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAV1P15498 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV1P15498 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV1P15498 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV1P15498 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV1P15498 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV1P15498 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAV1P15498 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAV1P15498 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV1P15498 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV1P15498 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV1P15498 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV1P15498 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV1P15498 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV1P15498 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAV1P15498 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAV1P15498 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV1P15498 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV1P15498 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV1P15498 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV1P15498 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV1P15498 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV1P15498 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV1P15498 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV1P15498 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV1P15498 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAV1P15498 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAV1P15498 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms