Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
UCHL3P15374 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UCHL3P15374 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms