Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RARGP13631 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARGP13631 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARGP13631 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARGP13631 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARGP13631 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARGP13631 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARGP13631 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARGP13631 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARGP13631 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARGP13631 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RARGP13631 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RARGP13631 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RARGP13631 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RARGP13631 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARGP13631 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARGP13631 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARGP13631 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARGP13631 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RARGP13631 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RARGP13631 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARGP13631 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARGP13631 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARGP13631 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARGP13631 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARGP13631 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARGP13631 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARGP13631 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RARGP13631 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARGP13631 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARGP13631 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARGP13631 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RARGP13631 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RARGP13631 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms