Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL5P13501 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL5P13501 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL5P13501 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL5P13501 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL5P13501 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCL5P13501 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCL5P13501 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCL5P13501 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL5P13501 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL5P13501 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL5P13501 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL5P13501 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL5P13501 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL5P13501 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL5P13501 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL5P13501 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCL5P13501 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCL5P13501 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCL5P13501 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCL5P13501 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL5P13501 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL5P13501 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL5P13501 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL5P13501 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL5P13501 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCL5P13501 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL5P13501 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL5P13501 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL5P13501 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL5P13501 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL5P13501 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCL5P13501 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms