Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM225BP0DP42 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms