Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV3-30-5P0DP03 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGHV3-30-5P0DP03 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms