Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
OPN1MW3P0DN78 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OPN1MW3P0DN78 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms