Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC166P0CW27 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC166P0CW27 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC166P0CW27 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms