Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT19P08727 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT19P08727 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT19P08727 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT19P08727 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT19P08727 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT19P08727 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT19P08727 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT19P08727 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT19P08727 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT19P08727 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT19P08727 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT19P08727 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT19P08727 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT19P08727 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT19P08727 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT19P08727 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT19P08727 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT19P08727 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT19P08727 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT19P08727 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT19P08727 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT19P08727 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT19P08727 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT19P08727 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT19P08727 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT19P08727 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT19P08727 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT19P08727 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT19P08727 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT19P08727 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT19P08727 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT19P08727 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT19P08727 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT19P08727 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT19P08727 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT19P08727 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT19P08727 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT19P08727 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT19P08727 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT19P08727 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT19P08727 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT19P08727 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT19P08727 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT19P08727 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT19P08727 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT19P08727 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT19P08727 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT19P08727 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT19P08727 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms