Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHBP07195 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHBP07195 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHBP07195 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHBP07195 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHBP07195 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHBP07195 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHBP07195 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHBP07195 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHBP07195 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHBP07195 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHBP07195 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHBP07195 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHBP07195 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHBP07195 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHBP07195 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHBP07195 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHBP07195 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHBP07195 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHBP07195 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHBP07195 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHBP07195 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHBP07195 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LDHBP07195 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LDHBP07195 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDHBP07195 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDHBP07195 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDHBP07195 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LDHBP07195 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDHBP07195 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDHBP07195 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LDHBP07195 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDHBP07195 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDHBP07195 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDHBP07195 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDHBP07195 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDHBP07195 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LDHBP07195 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LDHBP07195 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LDHBP07195 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LDHBP07195 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LDHBP07195 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms