Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGRP06401 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGRP06401 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGRP06401 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGRP06401 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGRP06401 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGRP06401 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGRP06401 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PGRP06401 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGRP06401 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGRP06401 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGRP06401 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGRP06401 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGRP06401 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGRP06401 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGRP06401 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGRP06401 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGRP06401 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGRP06401 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGRP06401 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGRP06401 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGRP06401 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGRP06401 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGRP06401 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGRP06401 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGRP06401 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PGRP06401 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGRP06401 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGRP06401 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGRP06401 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGRP06401 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGRP06401 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGRP06401 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGRP06401 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGRP06401 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms