Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPIND1P05546 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPIND1P05546 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms