Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR3DP05423 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR3DP05423 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3DP05423 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms