Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRUB2O95900 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRUB2O95900 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRUB2O95900 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms