Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDN9O95484 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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