Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1O95476 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CTDNEP1O95476 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDNEP1O95476 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms