Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN5O94779 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN5O94779 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms