Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JRKO75564 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
JRKO75564 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JRKO75564 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JRKO75564 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JRKO75564 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JRKO75564 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JRKO75564 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JRKO75564 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
JRKO75564 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JRKO75564 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JRKO75564 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JRKO75564 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JRKO75564 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JRKO75564 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JRKO75564 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JRKO75564 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JRKO75564 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JRKO75564 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JRKO75564 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JRKO75564 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JRKO75564 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JRKO75564 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
JRKO75564 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
JRKO75564 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
JRKO75564 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
JRKO75564 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JRKO75564 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JRKO75564 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JRKO75564 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JRKO75564 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JRKO75564 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JRKO75564 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JRKO75564 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JRKO75564 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JRKO75564 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JRKO75564 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JRKO75564 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
JRKO75564 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JRKO75564 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JRKO75564 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JRKO75564 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JRKO75564 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JRKO75564 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JRKO75564 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JRKO75564 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
JRKO75564 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JRKO75564 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JRKO75564 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JRKO75564 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JRKO75564 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JRKO75564 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JRKO75564 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JRKO75564 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JRKO75564 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JRKO75564 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JRKO75564 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms