Protein–RNA interactions for Protein: O60813

PRAMEF11, PRAME family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF11O60813 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF11O60813 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF11O60813 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms