Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNT1O60563 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNT1O60563 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNT1O60563 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNT1O60563 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNT1O60563 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNT1O60563 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNT1O60563 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNT1O60563 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNT1O60563 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms