Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
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VEGFDO43915 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VEGFDO43915 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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VEGFDO43915 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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VEGFDO43915 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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VEGFDO43915 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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VEGFDO43915 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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VEGFDO43915 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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VEGFDO43915 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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VEGFDO43915 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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VEGFDO43915 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFDO43915 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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