Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR3O43731 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR3O43731 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms