Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRID2O43424 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID2O43424 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID2O43424 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID2O43424 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID2O43424 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID2O43424 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID2O43424 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRID2O43424 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID2O43424 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID2O43424 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID2O43424 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID2O43424 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID2O43424 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID2O43424 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID2O43424 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID2O43424 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID2O43424 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID2O43424 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID2O43424 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID2O43424 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID2O43424 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID2O43424 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID2O43424 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID2O43424 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID2O43424 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID2O43424 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID2O43424 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID2O43424 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID2O43424 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID2O43424 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID2O43424 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID2O43424 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID2O43424 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID2O43424 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRID2O43424 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRID2O43424 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID2O43424 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID2O43424 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID2O43424 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID2O43424 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID2O43424 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID2O43424 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID2O43424 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID2O43424 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID2O43424 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID2O43424 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID2O43424 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID2O43424 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID2O43424 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID2O43424 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID2O43424 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID2O43424 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID2O43424 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID2O43424 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID2O43424 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID2O43424 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID2O43424 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID2O43424 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID2O43424 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID2O43424 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms