Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN3O15551 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN3O15551 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms