Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLGNO14967 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLGNO14967 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLGNO14967 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLGNO14967 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLGNO14967 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLGNO14967 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLGNO14967 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLGNO14967 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLGNO14967 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLGNO14967 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLGNO14967 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLGNO14967 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLGNO14967 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLGNO14967 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLGNO14967 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLGNO14967 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLGNO14967 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLGNO14967 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLGNO14967 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLGNO14967 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLGNO14967 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLGNO14967 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLGNO14967 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLGNO14967 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLGNO14967 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLGNO14967 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLGNO14967 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLGNO14967 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms