Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0C1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0C1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0C1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0C1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0C1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0C1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0C1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0C1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0C1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0C1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0C1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0C1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0C1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0C1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0C1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0C1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0C1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0C1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0C1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0C1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H7C0C1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H7C0C1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H7C0C1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H7C0C1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H7C0C1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
H7C0C1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0C1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0C1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0C1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0C1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0C1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0C1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0C1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0C1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0C1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0C1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0C1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0C1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0C1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0C1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0C1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0C1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0C1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0C1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0C1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0C1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0C1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H7C0C1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms