Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRRN3E7EW58 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRRN3E7EW58 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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