Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3CLB5ME19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3CLB5ME19 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms