Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VGLL3A8MV65 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VGLL3A8MV65 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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