Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NOTOA8MTQ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NOTOA8MTQ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms