Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
VPS37CA5D8V6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS37CA5D8V6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms