Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA8A3KMH1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms