Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A087X0T9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X0T9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms