Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms