Protein–RNA interactions for Protein: S4R325

URGCP-MRPS24, URGCP-MRPS24 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URGCP-MRPS24S4R325 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
URGCP-MRPS24S4R325 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URGCP-MRPS24S4R325 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
URGCP-MRPS24S4R325 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
URGCP-MRPS24S4R325 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
URGCP-MRPS24S4R325 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
URGCP-MRPS24S4R325 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
URGCP-MRPS24S4R325 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
URGCP-MRPS24S4R325 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
URGCP-MRPS24S4R325 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
URGCP-MRPS24S4R325 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
URGCP-MRPS24S4R325 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
URGCP-MRPS24S4R325 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
URGCP-MRPS24S4R325 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
URGCP-MRPS24S4R325 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
URGCP-MRPS24S4R325 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
URGCP-MRPS24S4R325 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
URGCP-MRPS24S4R325 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
URGCP-MRPS24S4R325 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
URGCP-MRPS24S4R325 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
URGCP-MRPS24S4R325 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
URGCP-MRPS24S4R325 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
URGCP-MRPS24S4R325 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
URGCP-MRPS24S4R325 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
URGCP-MRPS24S4R325 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
URGCP-MRPS24S4R325 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
URGCP-MRPS24S4R325 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
URGCP-MRPS24S4R325 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
URGCP-MRPS24S4R325 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
URGCP-MRPS24S4R325 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
URGCP-MRPS24S4R325 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
URGCP-MRPS24S4R325 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
URGCP-MRPS24S4R325 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
URGCP-MRPS24S4R325 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
URGCP-MRPS24S4R325 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
URGCP-MRPS24S4R325 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
URGCP-MRPS24S4R325 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
URGCP-MRPS24S4R325 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
URGCP-MRPS24S4R325 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
URGCP-MRPS24S4R325 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
URGCP-MRPS24S4R325 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
URGCP-MRPS24S4R325 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
URGCP-MRPS24S4R325 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
URGCP-MRPS24S4R325 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
URGCP-MRPS24S4R325 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
URGCP-MRPS24S4R325 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
URGCP-MRPS24S4R325 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
URGCP-MRPS24S4R325 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
URGCP-MRPS24S4R325 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
URGCP-MRPS24S4R325 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms