Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRRAPQ9Y4A5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRRAPQ9Y4A5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRRAPQ9Y4A5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRRAPQ9Y4A5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRRAPQ9Y4A5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRRAPQ9Y4A5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRRAPQ9Y4A5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRRAPQ9Y4A5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRRAPQ9Y4A5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRRAPQ9Y4A5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRRAPQ9Y4A5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRRAPQ9Y4A5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRRAPQ9Y4A5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRRAPQ9Y4A5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRRAPQ9Y4A5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRRAPQ9Y4A5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRRAPQ9Y4A5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRRAPQ9Y4A5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRRAPQ9Y4A5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRRAPQ9Y4A5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRRAPQ9Y4A5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRRAPQ9Y4A5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRRAPQ9Y4A5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRRAPQ9Y4A5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRRAPQ9Y4A5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRRAPQ9Y4A5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRRAPQ9Y4A5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRRAPQ9Y4A5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRRAPQ9Y4A5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRRAPQ9Y4A5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRRAPQ9Y4A5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRRAPQ9Y4A5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRRAPQ9Y4A5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRRAPQ9Y4A5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRRAPQ9Y4A5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRRAPQ9Y4A5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRRAPQ9Y4A5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRRAPQ9Y4A5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRRAPQ9Y4A5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRRAPQ9Y4A5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRRAPQ9Y4A5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRRAPQ9Y4A5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRRAPQ9Y4A5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRRAPQ9Y4A5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRRAPQ9Y4A5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRRAPQ9Y4A5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRRAPQ9Y4A5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRRAPQ9Y4A5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRRAPQ9Y4A5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRRAPQ9Y4A5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRRAPQ9Y4A5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRRAPQ9Y4A5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRRAPQ9Y4A5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRRAPQ9Y4A5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRRAPQ9Y4A5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRRAPQ9Y4A5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms