Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B6Q9Y3B4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3B6Q9Y3B4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B6Q9Y3B4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B6Q9Y3B4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B6Q9Y3B4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B6Q9Y3B4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B6Q9Y3B4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B6Q9Y3B4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B6Q9Y3B4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B6Q9Y3B4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B6Q9Y3B4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B6Q9Y3B4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B6Q9Y3B4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B6Q9Y3B4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B6Q9Y3B4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B6Q9Y3B4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF3B6Q9Y3B4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF3B6Q9Y3B4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF3B6Q9Y3B4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B6Q9Y3B4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF3B6Q9Y3B4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF3B6Q9Y3B4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SF3B6Q9Y3B4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF3B6Q9Y3B4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B6Q9Y3B4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B6Q9Y3B4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B6Q9Y3B4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B6Q9Y3B4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B6Q9Y3B4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B6Q9Y3B4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B6Q9Y3B4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B6Q9Y3B4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B6Q9Y3B4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B6Q9Y3B4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF3B6Q9Y3B4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF3B6Q9Y3B4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3B6Q9Y3B4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3B6Q9Y3B4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3B6Q9Y3B4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3B6Q9Y3B4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B6Q9Y3B4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3B6Q9Y3B4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF3B6Q9Y3B4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SF3B6Q9Y3B4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms