Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPB41L3Q9Y2J2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPB41L3Q9Y2J2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPB41L3Q9Y2J2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPB41L3Q9Y2J2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPB41L3Q9Y2J2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPB41L3Q9Y2J2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPB41L3Q9Y2J2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPB41L3Q9Y2J2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EPB41L3Q9Y2J2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EPB41L3Q9Y2J2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EPB41L3Q9Y2J2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EPB41L3Q9Y2J2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPB41L3Q9Y2J2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EPB41L3Q9Y2J2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EPB41L3Q9Y2J2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPB41L3Q9Y2J2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPB41L3Q9Y2J2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPB41L3Q9Y2J2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPB41L3Q9Y2J2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPB41L3Q9Y2J2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPB41L3Q9Y2J2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPB41L3Q9Y2J2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPB41L3Q9Y2J2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPB41L3Q9Y2J2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L3Q9Y2J2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPB41L3Q9Y2J2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L3Q9Y2J2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPB41L3Q9Y2J2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPB41L3Q9Y2J2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EPB41L3Q9Y2J2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EPB41L3Q9Y2J2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPB41L3Q9Y2J2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L3Q9Y2J2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EPB41L3Q9Y2J2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPB41L3Q9Y2J2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPB41L3Q9Y2J2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
EPB41L3Q9Y2J2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPB41L3Q9Y2J2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPB41L3Q9Y2J2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPB41L3Q9Y2J2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPB41L3Q9Y2J2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPB41L3Q9Y2J2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPB41L3Q9Y2J2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPB41L3Q9Y2J2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L3Q9Y2J2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L3Q9Y2J2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L3Q9Y2J2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L3Q9Y2J2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L3Q9Y2J2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L3Q9Y2J2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L3Q9Y2J2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L3Q9Y2J2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPB41L3Q9Y2J2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPB41L3Q9Y2J2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EPB41L3Q9Y2J2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPB41L3Q9Y2J2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPB41L3Q9Y2J2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPB41L3Q9Y2J2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms