Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A1LQ9UNN4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A1LQ9UNN4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2A1LQ9UNN4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2A1LQ9UNN4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A1LQ9UNN4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2A1LQ9UNN4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2A1LQ9UNN4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A1LQ9UNN4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A1LQ9UNN4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A1LQ9UNN4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A1LQ9UNN4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A1LQ9UNN4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A1LQ9UNN4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2A1LQ9UNN4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2A1LQ9UNN4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A1LQ9UNN4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A1LQ9UNN4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A1LQ9UNN4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A1LQ9UNN4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A1LQ9UNN4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A1LQ9UNN4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A1LQ9UNN4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A1LQ9UNN4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2A1LQ9UNN4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2A1LQ9UNN4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A1LQ9UNN4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A1LQ9UNN4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2A1LQ9UNN4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A1LQ9UNN4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A1LQ9UNN4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms