Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNX12Q9UMY4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNX12Q9UMY4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SNX12Q9UMY4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SNX12Q9UMY4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNX12Q9UMY4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX12Q9UMY4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNX12Q9UMY4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNX12Q9UMY4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SNX12Q9UMY4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNX12Q9UMY4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNX12Q9UMY4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNX12Q9UMY4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX12Q9UMY4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX12Q9UMY4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX12Q9UMY4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX12Q9UMY4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX12Q9UMY4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX12Q9UMY4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX12Q9UMY4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SNX12Q9UMY4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX12Q9UMY4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX12Q9UMY4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX12Q9UMY4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX12Q9UMY4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX12Q9UMY4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX12Q9UMY4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNX12Q9UMY4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNX12Q9UMY4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNX12Q9UMY4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNX12Q9UMY4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX12Q9UMY4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX12Q9UMY4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX12Q9UMY4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX12Q9UMY4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX12Q9UMY4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNX12Q9UMY4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX12Q9UMY4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX12Q9UMY4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNX12Q9UMY4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX12Q9UMY4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX12Q9UMY4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX12Q9UMY4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX12Q9UMY4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX12Q9UMY4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX12Q9UMY4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX12Q9UMY4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX12Q9UMY4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNX12Q9UMY4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX12Q9UMY4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX12Q9UMY4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SNX12Q9UMY4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX12Q9UMY4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX12Q9UMY4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX12Q9UMY4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX12Q9UMY4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX12Q9UMY4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX12Q9UMY4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX12Q9UMY4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNX12Q9UMY4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX12Q9UMY4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX12Q9UMY4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX12Q9UMY4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX12Q9UMY4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX12Q9UMY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX12Q9UMY4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX12Q9UMY4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX12Q9UMY4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX12Q9UMY4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX12Q9UMY4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNX12Q9UMY4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX12Q9UMY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX12Q9UMY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX12Q9UMY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX12Q9UMY4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX12Q9UMY4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX12Q9UMY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX12Q9UMY4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX12Q9UMY4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SNX12Q9UMY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms