Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKF7

PITPNC1, Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNC1Q9UKF7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNC1Q9UKF7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNC1Q9UKF7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PITPNC1Q9UKF7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITPNC1Q9UKF7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITPNC1Q9UKF7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITPNC1Q9UKF7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITPNC1Q9UKF7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PITPNC1Q9UKF7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITPNC1Q9UKF7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITPNC1Q9UKF7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITPNC1Q9UKF7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITPNC1Q9UKF7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITPNC1Q9UKF7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITPNC1Q9UKF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITPNC1Q9UKF7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PITPNC1Q9UKF7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITPNC1Q9UKF7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITPNC1Q9UKF7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNC1Q9UKF7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITPNC1Q9UKF7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITPNC1Q9UKF7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PITPNC1Q9UKF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITPNC1Q9UKF7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITPNC1Q9UKF7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITPNC1Q9UKF7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITPNC1Q9UKF7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PITPNC1Q9UKF7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITPNC1Q9UKF7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms