Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK12

ZNF222, Zinc finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF222Q9UK12 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF222Q9UK12 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF222Q9UK12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF222Q9UK12 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF222Q9UK12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF222Q9UK12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF222Q9UK12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF222Q9UK12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF222Q9UK12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF222Q9UK12 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF222Q9UK12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF222Q9UK12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF222Q9UK12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF222Q9UK12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF222Q9UK12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF222Q9UK12 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF222Q9UK12 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF222Q9UK12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF222Q9UK12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF222Q9UK12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF222Q9UK12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF222Q9UK12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF222Q9UK12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF222Q9UK12 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF222Q9UK12 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF222Q9UK12 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF222Q9UK12 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF222Q9UK12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF222Q9UK12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF222Q9UK12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF222Q9UK12 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF222Q9UK12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF222Q9UK12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF222Q9UK12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF222Q9UK12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF222Q9UK12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF222Q9UK12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF222Q9UK12 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF222Q9UK12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF222Q9UK12 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms